Python 性能分析入门指南

虽然并非你编写的每个 Python 程序都要求一个严格的性能分析,但是让人放心的是,当问题发生的时候,Python 生态圈有各种各样的工具可以处理这类问题。

分析程序的性能可以归结为回答四个基本问题:

  1. 正运行的多快
  2. 速度瓶颈在哪里
  3. 内存使用率是多少
  4. 内存泄露在哪里

下面,我们将用一些神奇的工具深入到这些问题的答案中去。

用 time 粗粒度的计算时间

让我们开始通过使用一个快速和粗暴的方法计算我们的代码:传统的 unix time 工具。

三个输出测量值之间的详细意义在这里 stackoverflow article,但简介在这:

  • real — 指的是实际耗时
  • user — 指的是内核之外的 CPU 耗时
  • sys — 指的是花费在内核特定函数的 CPU 耗时

你会有你的应用程序用完了多少 CPU 周期的即视感,不管系统上其他运行的程序添加的系统和用户时间。

如果 sys 和 user 时间之和小于 real 时间,然后你可以猜测到大多数程序的性能问题最有可能与 IO wait 相关。

用 timing context 管理器细粒度的计算时间

我们下一步的技术包括直接嵌入代码来获取细粒度的计时信息。下面是我进行时间测量的代码的一个小片段

timer.py

为了使用它,使用 Python 的 with 关键字和 Timer 上下文管理器来包装你想计算的代码。当您的代码块开始执行,它将照顾启动计时器,当你的代码块结束的时候,它将停止计时器。

这个代码片段示例:

为了看看我的程序的性能随着时间的演化的趋势,我常常记录这些定时器的输出到一个文件中。

使用 profiler 逐行计时和分析执行的频率

罗伯特·克恩有一个不错的项目称为 line_profiler , 我经常使用它来分析我的脚本有多快,以及每行代码执行的频率:

为了使用它,你可以通过使用 pip 来安装它:

安装完成后,你将获得一个新模块称为 line_profiler 和 kernprof.py 可执行脚本。

为了使用这个工具,首先在你想测量的函数上设置 @profile 修饰符。不用担心,为了这个修饰符,你不需要引入任何东西。kernprof.py 脚本会在运行时自动注入你的脚本。

primes.py

一旦你得到了你的设置了修饰符 @profile 的代码,使用 kernprof.py 运行这个脚本。

-l 选项告诉 kernprof 把修饰符 @profile 注入你的脚本,-v 选项告诉 kernprof 一旦你的脚本完成后,展示计时信息。这是一个以上脚本的类似输出:

寻找 hits 值比较高的行或是一个高时间间隔。这些地方有最大的优化改进空间。

它使用了多少内存?

现在我们掌握了很好我们代码的计时信息,让我们继续找出我们的程序使用了多少内存。我们真是非常幸运, Fabian Pedregosa 仿照 Robert Kern 的 line_profiler 实现了一个很好的内存分析器 [memory profiler][5]

首先通过 pip 安装它:

在这里建议安装 psutil 是因为该包能提升 memory_profiler 的性能。

想 line_profiler 一样, memory_profiler 要求在你设置 @profile 来修饰你的函数:

运行如下命令来显示你的函数使用了多少内存:

一旦你的程序退出,你应该可以看到这样的输出:

line_profiler 和 memory_profiler 的 IPython 快捷命令

line_profiler 和 memory_profiler 一个鲜为人知的特性就是在 IPython 上都有快捷命令。你所能做的就是在 IPython 上键入以下命令:

这样做了以后,你就可以使用魔法命令 %lprun 和 %mprun 了,它们表现的像它们命令行的副本,最主要的不同就是你不需要给你需要分析的函数设置 @profile 修饰符。直接在你的 IPython 会话上继续分析吧。

这可以节省你大量的时间和精力,因为使用这些分析命令,你不需要修改你的源代码。

哪里内存溢出了?

cPython的解释器使用引用计数来作为它跟踪内存的主要方法。这意味着每个对象持有一个计数器,当增加某个对象的引用存储的时候,计数器就会增加,当一个引用被删除的时候,计数器就是减少。当计数器达到0, cPython 解释器就知道该对象不再使用,因此解释器将删除这个对象,并且释放该对象持有的内存。

内存泄漏往往发生在即使该对象不再使用的时候,你的程序还持有对该对象的引用。

最快速发现内存泄漏的方式就是使用一个由 Marius Gedminas 编写的非常好的称为 [objgraph][6] 的工具。
这个工具可以让你看到在内存中对象的数量,也定位在代码中所有不同的地方,对这些对象的引用。

开始,我们首先安装 objgraph

一旦你安装了这个工具,在你的代码中插入一个调用调试器的声明。

哪个对象最常见

在运行时,你可以检查在运行在你的程序中的前20名最普遍的对象

哪个对象被增加或是删除了?

我们能在两个时间点之间看到哪些对象被增加或是删除了。

这个泄漏对象的引用是什么?

继续下去,我们还可以看到任何给定对象的引用在什么地方。让我们以下面这个简单的程序举个例子。

为了看到持有变量 X 的引用是什么,运行 objgraph.show_backref() 函数:

该命令的输出是一个 PNG 图片,被存储在 /tmp/backrefs.png,它应该看起来像这样:

backrefs (1)

 

盒子底部有红色字体就是我们感兴趣的对象,我们可以看到它被符号 x 引用了一次,被列表 y 引用了三次。如果 x 这个对象引起了内存泄漏,我们可以使用这种方法来追踪它的所有引用,以便看到为什么它没有被自动被收回。

回顾一遍,objgraph 允许我们:

  • 显示占用 Python 程序内存的前 N 个对象
  • 显示在一段时期内哪些对象被增加了,哪些对象被删除了
  • 显示我们脚本中获得的所有引用

Effort vs precision

在这篇文章中,我展示了如何使用一些工具来分析一个python程序的性能。通过这些工具和技术的武装,你应该可以获取所有要求追踪大多数内存泄漏以及在Python程序快速识别瓶颈的信息。

和许多其他主题一样,运行性能分析意味着要在付出和精度之间的平衡做取舍。当有疑问是,用最简单的方案,满足你当前的需求。

1 3 收藏 评论

相关文章

可能感兴趣的话题



直接登录
跳到底部
返回顶部